一是思想認識不到位。少數人對抓非公企業和社會組織黨建工作規范化存在畏難情緒，認為非公經濟底子薄，小個專企業多，黨員人數少，人員不固定且流動快，抓黨建規范化建設難度大。少數企業主不理解，不支持，片面追求經濟利益最大化，只關心企業生產經營和市場營銷，擔心抓黨建會浪費人力物力和財力，影響企業的正常生產經營和管理決策。

二是工作進展不平衡。從當前情況看，規模較大的企業要好于小微企業，單獨建的支部要好于聯合建的支部，掛靠城鎮社區管理的要好于掛靠農村管理的。特別是個別企業在成立之初，均能按照“六有”抓支部建設，但隨著人員流動，出現有陣地無黨員的現象，黨組織基本處于“停擺”狀態，規范化建設根本無從抓起。

三是作用發揮不明顯。少數黨組織仍沒有將黨建工作與企業發展、社會效益結合起來；有的黨組織書記存在“雇傭”思想，認為自己是“打工”的，往往看企業主臉色行事，不能理直氣壯抓黨建，難以在職工群眾中產生影響，不能充分發揮黨組織的政治核心作用和引領企業發展作用。